Project Root

• Overview
• cassiopeia
  • Overview
  • critique
  • data
  • mixins
  • plotting
  • preprocess
  • simulator
  • solver
  • tools
    • Overview
    • branch_length_estimator
    • fitness_estimator
      • Overview
      • _jungle
        • Overview
        • jungle
          • Overview
          • resources
            • Overview
            • betatree
              • Overview
              • src
                • Overview
                • betatree.py
                • sfs.py
                • sfs_py3.py
                • __init__.py
              • __init__.py
            • FitnessInference
            • __init__.py
          • forest.py
          • sfs.py
          • size_matched_model.py
          • tree.py
          • __init__.py
        • reference_data
      • __init__.py
      • _FitnessEstimator.py
      • _lbi_jungle.py
    • autocorrelation.py
    • coupling.py
    • parameter_estimators.py
    • small_parsimony.py
    • topology.py
    • tree_metrics.py
    • __init__.py
  • __init__.py
• docs
• test
• .github
• build.py
• codecov.yml
• conftest.py
• pyproject.toml
• README.md
• setup.py
• version.py
• .readthedocs.yml